山东国防工业管理体制经历了一个不断发展、调整、改革的过程。1947年前，山东省军区设军工部，负责管理国防工业。1947年至1948年，华中军区军工部与山东省军区军工部合编为华东军区军工部。1948年4月，华东军区军工部更名为华东财经办事处工矿部。1949年7月，华东财经办事处工矿部更名为山东省人民政府工矿部。1950年6月，山东省人民政府工矿部更名为华东军政委员会工业部山东办事处。1952年，华东军政委员会工业部山东办事处并入山东省人民政府工业厅。1964年10月，成立山东省后方建设办公室，11月，济南军区政治部国防工业工作部成立，负责管理中央驻鲁国防工业企业、事业单位及山东省军工企业的党的工作和政治思想工作。1965年4月，成立山东省机械工业厅军工局，负责管理本省地方军工企业和动员任务。1966年7月，山东省后方建设办公室改为山东省人民委员会国防工业办公室。1969年3月，成立“山东省革命委员会、山东省军区国防工业办公室”， 11月更名为“山东省革命委员会、济南军区国防工业办公室”。1973年11月，撤销“山东省革命委员会、济南军区国防工业办公室”，成立山东省革命委员会国防工业办公室，与省革委生产指挥部工业交通办公室合署办公，同时成立山东省革命委员会第二机械工业局，负责管理全省国防工业企事业单位和“小三线”各军工厂。1975年8月，山东省革命委员会第二机械工业局更名为山东省革命委员会军事工业局。1979年12月，山东省革命委员会军事工业局更名为山东省军事工业局。1983年7月，山东省军事工业局更名为山东省国防科学技术工业办公室，简称山东省国防科工办。2000年以来，山东省国防科工办负责全省军事工业、民用爆炸物品、船舶工业行业管理以及核应急管理等工作。
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